Arrêt de travail du médecin libéral : qui vous paie, combien, et ce qu'il reste à assurer
11 octobre 2026 · 10 min de lecture
Par Dr Malik Moustarhfir, médecin radiologue libéral, dirigeant de SELAS, certifié AMF.
Carence, indemnités CPAM du 4e au 90e jour, relais CARMF à partir du 91e jour, invalidité : les montants officiels 2026 et le reste à assurer pour le praticien.
En cas d'arrêt de travail, le médecin libéral ne perçoit plus son revenu habituel. Qu'il s'agisse d'un arrêt maladie ou d'une incapacité temporaire de travail, il entre dans un circuit à trois étages : trois jours sans rien, puis l'Assurance Maladie jusqu'au 90e jour, puis la CARMF. Chaque étage obéit à ses propres règles, ses propres plafonds et ses propres formalités.
Depuis le 1er juillet 2021, les professionnels libéraux affiliés à la CNAVPL, dont les médecins, bénéficient d'indemnités journalières versées par la CPAM pendant les 90 premiers jours (article 69 de la LFSS pour 2021, décret n° 2021-755 du 12 juin 2021). Avant cette réforme, un médecin n'était indemnisé qu'à partir du 91e jour.
Cet article reprend les montants 2026 des indemnités journalières du médecin libéral, publiés par l'Assurance Maladie et la CARMF, sur la base d'un plafond annuel de la Sécurité sociale (PASS) de 48 060 €, puis mesure ce qui reste réellement à la charge du praticien.
Indemnités journalières de l'Assurance maladie : du 4e au 90e jour
Les trois premiers jours de l'arrêt ne sont pas indemnisés : c'est le délai de carence du médecin libéral, commun aux professions libérales relevant du régime des praticiens et auxiliaires médicaux conventionnés (PAMC). Il s'applique à chaque nouvel arrêt, sauf prolongation. Pour un praticien qui réalise 1 200 € de chiffre d'affaires par jour, ces 3 jours de carence représentent déjà 3 600 € de recettes perdues, alors que les charges du cabinet continuent de courir.
La réforme des indemnités journalières des libéraux de juillet 2021 a mis fin aux 90 jours de carence que connaissaient les médecins : les IJ CPAM du médecin sont désormais versées dès le 4e jour.
Le calcul des indemnités journalières des professions libérales est le suivant : 1/730e du revenu moyen des trois dernières années civiles, retenu dans la limite de 3 PASS. Le revenu pris en compte est celui qui sert au calcul des cotisations sociales recouvrées par l'Urssaf, dans la limite du plafond annuel de la Sécurité sociale (PASS) 2026 multiplié par trois.
En 2026, le montant de l'indemnité journalière du médecin libéral est compris entre 26,33 € par jour (revenu inférieur à 40 % du PASS) et 197,51 € par jour (revenu égal ou supérieur à 3 PASS, soit 144 180 €). Il faut justifier d'au moins douze mois d'affiliation, être à jour de ses cotisations et adresser l'avis d'arrêt de travail à sa CPAM dans les 48 heures, par le service en ligne d'ameli ou sur le formulaire papier.
La durée d'indemnisation est limitée à 87 jours par arrêt, soit jusqu'au 90e jour. Au-delà, le relais est assuré par la CARMF.
Ameli : les indemnités journalières du professionnel libéral
- Carence : 3 jours
- Montant : 1/730e du revenu moyen des 3 dernières années, plafonné à 3 PASS
- Fourchette 2026 : 26,33 € à 197,51 € par jour
- Conditions : 12 mois d'affiliation, cotisations à jour
Indemnités journalières CARMF : à partir du 91e jour
La CARMF parle d'incapacité temporaire d'exercice. Son régime invalidité-décès verse des indemnités journalières à partir du 91e jour d'arrêt, à condition d'être à jour de ses cotisations CARMF, pendant une durée maximale de trois ans (1 095 jours), continus ou non. Le montant dépend de la classe de cotisation, déterminée par le revenu non salarié de l'avant-dernière année.
En 2026, la classe A (revenu inférieur à 1 PASS) donne droit à 65,84 € par jour ; la classe B (revenu compris entre 1 et 3 PASS) à 1/730e du revenu, soit entre 65,84 € et 197,51 € ; la classe C (revenu au moins égal à 3 PASS) à 197,51 € par jour. Ces montants peuvent être majorés en présence d'enfants à charge ou de conjoint, selon les règles du régime.
La cotisation 2026 au régime invalidité-décès s'élève à 626 € pour un revenu inférieur à 1 PASS, à 434 € plus 0,4 % du revenu entre 1 et 3 PASS, et à 1 010 € au-delà de 3 PASS.
- Classe A, revenu inférieur à 48 060 € : 65,84 € par jour
- Classe B, revenu entre 48 060 € et 144 180 € : 1/730e du revenu
- Classe C, revenu au moins égal à 144 180 € : 197,51 € par jour
- Durée maximale : 36 mois à compter du 91e jour
Invalidité et décès : ce que prévoit la CARMF
Si l'incapacité se prolonge, la CARMF peut verser une pension d'invalidité, mais uniquement en cas d'invalidité totale et définitive à l'exercice de la profession médicale. Selon la classe, la rente annuelle se situe en 2026 entre environ 23 662 € et 31 549 €, hors majorations familiales.
Le point essentiel est ailleurs : une invalidité partielle, même importante, n'ouvre aucun droit à pension au titre du régime obligatoire. Un radiologue qui ne peut plus assurer qu'une partie de ses vacations ne perçoit rien de la CARMF. L'inaptitude s'apprécie au regard de l'exercice de la médecine, inscrite au tableau de l'Ordre des médecins.
En cas de décès, le même régime invalidité-décès prévoit un capital décès et des rentes pour le conjoint et les orphelins, selon les règles et les montants fixés par la CARMF. Ces prestations protègent la famille, sans remplacer un revenu de praticien.
Combien touche un médecin libéral en arrêt maladie : trois exemples
Premier exemple : un médecin généraliste dont le revenu est de 60 000 €. Son revenu journalier rapporté à l'année est d'environ 164 €. La CPAM lui verse environ 82 € par jour (1/730e de son revenu), soit une perte de revenus de moitié pendant l'arrêt maladie.
Deuxième exemple : un praticien dont le revenu est de 150 000 €. Son revenu journalier rapporté à l'année est d'environ 411 €. Le régime obligatoire lui verse au maximum 197,51 € par jour : moins de la moitié de son revenu, avant même de payer les charges fixes du cabinet (loyer, personnel, crédit d'équipement), qui continuent pendant l'arrêt.
Troisième exemple : un radiologue ou un chirurgien de secteur 2 dont le revenu atteint 250 000 €. Le plafond de 3 PASS des indemnités journalières joue à plein : le régime obligatoire couvre moins de 30 % de son revenu, et rien du loyer ni des salariés du cabinet pendant l'arrêt.
Prévoyance du médecin libéral : ce qu'il reste à assurer
Le contrat de prévoyance individuel doit donc couvrir quatre besoins distincts : la franchise des premiers jours, le complément de revenu jusqu'au 90e jour et au-delà, les frais généraux du cabinet, et l'invalidité partielle, que le régime obligatoire ignore.
- Indemnités journalières complémentaires, avec une franchise adaptée à votre épargne de précaution
- Garantie frais généraux pour les charges fixes du cabinet
- Rente d'invalidité couvrant l'invalidité partielle, idéalement au barème professionnel
- Revalorisation des garanties lorsque le revenu progresse
La méthode : partir des chiffres officiels
Face à un arrêt de travail, le médecin libéral a donc intérêt à anticiper. Avant toute souscription, il faut reconstituer, mois par mois, ce que verseraient la CPAM puis la CARMF selon votre revenu réel, et mesurer l'écart avec vos besoins personnels et professionnels. Le contrat se calibre sur cet écart, pas sur un montant forfaitaire proposé par défaut.
Le cabinet Wealthier Life Capital accompagne les praticiens dans cette analyse et dans la constitution d'un revenu issu de leur patrimoine, qui forme la dernière ligne de défense en cas d'arrêt prolongé.
À retenir
- Les 3 premiers jours d'arrêt ne sont pas indemnisés par le régime obligatoire.
- Du 4e au 90e jour, la CPAM verse 1/730e du revenu moyen sur 3 ans, entre 26,33 € et 197,51 € par jour en 2026.
- À partir du 91e jour, la CARMF verse entre 65,84 € et 197,51 € par jour, pendant 3 ans au maximum.
- L'invalidité partielle n'est pas couverte par la CARMF : c'est le premier risque à assurer.
- Les charges fixes du cabinet ne sont couvertes par aucun régime obligatoire.
Questions fréquentes
- Un médecin libéral a-t-il droit aux indemnités journalières ?
- Oui. Depuis le 1er juillet 2021, la CPAM verse des indemnités journalières du 4e au 90e jour, sous réserve de 12 mois d'affiliation et de cotisations à jour. La CARMF prend le relais à partir du 91e jour.
- Qui paie l'arrêt maladie d'un médecin libéral ?
- L'Assurance maladie (CPAM) du 4e au 90e jour, puis la CARMF à partir du 91e jour, pendant 36 mois au maximum. Les 3 premiers jours et les charges du cabinet restent à la charge du praticien, sauf contrat de prévoyance.
- Combien touche un médecin libéral en arrêt maladie ?
- En 2026, la CPAM verse 1/730e du revenu moyen des 3 dernières années, entre 26,33 € et 197,51 € par jour. La CARMF verse ensuite entre 65,84 € et 197,51 € par jour selon la classe de cotisation.
- Combien de jours de carence pour un médecin libéral ?
- Trois jours. Ils s'appliquent à chaque nouvel arrêt, sauf prolongation d'un arrêt précédent.
- Que se passe-t-il après 90 jours d'arrêt ?
- La CPAM cesse de verser ses indemnités et la CARMF prend le relais au titre de l'incapacité temporaire d'exercice, à condition d'être à jour de ses cotisations.
- Combien de temps la CARMF verse-t-elle des indemnités ?
- Pendant 3 ans au maximum (1 095 jours), à compter du 91e jour d'arrêt. Au-delà, seule une invalidité totale et définitive ouvre droit à une pension.
- Faut-il une prévoyance quand on est médecin libéral ?
- Oui dans la plupart des cas : le régime obligatoire est plafonné à 3 PASS, ne couvre ni les frais du cabinet ni l'invalidité partielle. Un contrat individuel comble ces écarts.
Sur le même sujet
Prévoyance médecin libéral : comment lire et choisir son contrat
Franchise, définition de l'invalidité, exclusions psychiques et dorsales, revalorisation : audit technique d'un contrat de prévoyance de praticien.
RetraiteRetraite médecin CARMF : calcul, taux de remplacement et solutions
Régime de base, complémentaire, ASV : comment se calcule la retraite d'un médecin libéral, quel taux de remplacement attendre et quels leviers activer dès 45 ans.
StructurationSELARL médecin : intérêt, fonctionnement et arbitrages
Seuils de bascule, rémunération et dividendes, trésorerie investie à l'IS, holding : le mode d'emploi de la société d'exercice pour un praticien.
Prendre rendez-vous
Un point sur votre dossier, avec le cabinet compétent.
Choisissez votre sujet : l'échange de 30 minutes se fait directement avec l'équipe concernée, sans engagement.
Wealthier Life Capital
Gestion de patrimoine et investissement
Allocation diversifiée, préparation retraite, investissement financier.
Docteur Compta
Comptabilité du cabinet et des investissements
Bilan, prévisionnel, rentabilité et obligations déclaratives.
Docteur Fiscal
Fiscalité & structuration libérale
SELARL, SELAS, holding, SCI et arbitrages fiscaux.